醫務衞生局致力資助本地醫療衞生研究及促進健康計劃。其管核下的醫療衞生基金 （下稱「基金」）可透過本地和世界研究所取得的科學知識，及把這些知識轉化為臨牀實踐，提供更多和更好的實證，以支持癌症預防、診斷、治療和存活，及制定以實證為本的衞生政策，以降低癌症發病率及死亡率，減輕病情，並改善病人的生活質素。基金將會優先資助與癌症相關的研究。
基金為下列各類項目提供撥款資助:
a. 研究員擬定項目（撥款上限：每個項目150萬港元；年期3年） — 資助個別申請人因應基金的公開邀請，按研究範疇及優先課題所提交的研究項目。
b. 政府委託的項目 — 資助委託進行的特定計劃，以建立科研能力、填補科研知識不足之處、協助制訂政策、應對特定事件，以及評估需要和威脅。資助範圍可涵蓋研究項目、設備、基礎設施及其他建立科研能力的措施。
c. 研究獎學金計劃（撥款上限：每個獎學金120萬港元；年期2年） — 旨在提高科研能力和建立有助把知識應用於制訂醫療政策及臨床實務的科研能力。因應研究局的意見，合資格的申請人會獲頒授研究獎學金，獎學金涵蓋一系列研究範疇及專科。
有關研究員擬定項目及研究獎學金計劃的申請詳情及撥款項目資料，請瀏覽研究基金秘書處網頁。
研究局通過成立五個專家顧問小組為其顧問部門，包括癌症專家顧問小組、基層醫療及非傳染病專家顧問小組、傳染病專家顧問小組、精神健康專家顧問小組及執行科學專家顧問小組，為基金就促進科研及制定研究議程提供建議。成員包括在癌症研究和醫療保健領域最前沿的本地專家。2019年度公開申請的研究員擬定項目有關癌症的優次課題包括：
有關研究員擬定項目及研究獎學金計劃的申請詳情及撥款項目資料，請瀏覽研究基金秘書處網頁。
基金資助與癌症相關的委託研究項目包括：
基金委託了香港中文大學及香港大學於2015年各進行一項為期4-5年的研究以評估大腸癌篩查先導計劃的整體表現，包括其有效性和成本效益、用戶和服務提供者的滿意度、公眾認知的改變、觀感、接受程度和使用篩查的公平性。這兩項研究的總資助額為2,200萬港元。
基金委託了香港大學於2015年進行一項為期5年關於本地婦女乳癌的相關風險的研究。這項研究的目標是利用病例對照研究方法（對比有乳癌和無乳癌的婦女）制定香港的乳癌風險預測模型。它還旨在找出風險因素（如年齡、體重指標、其他個人特徵、體能活動、乳癌家族史和良性乳腺疾病歷史等）與乳癌發展的關係。這項研究的資助額為1,900萬港元。
為了解決癌症的主要風險因素 - 與煙草相關的危害，基金已於2019年委託了香港大學進行一項為期3年的研究以評估煙草控制政策對香港的影響。該研究旨在建立一項有系統的調查，以判斷現有煙草控制措施的成效，並根據研究結果建議新措施。這項研究的資助額為900萬港元。
基金於2019年委託了香港中文大學進行一項為期5年的人口追蹤研究，以研究阿士匹靈對多種癌症的化學保護作用。這項研究將評估長期使用阿士匹靈是否與降低癌症發病率和死亡率相關，並透過檢視超過600,000名病人的臨牀記錄，評估阿士匹靈的效益比其潛在出血情況的風險更為重要。這項研究的資助額為985萬港元。
基金亦資助了兩所第一期臨牀試驗中心（下稱「中心」）的基礎設施，用於進行早期臨牀試驗，而5年的總資助額為8,000萬港元。自2014年以來，這兩所中心已開始對各種癌症不同治療方法的安全性、藥理和療效進行試驗，包括肝癌、肺癌、乳癌、結腸癌、腎癌和其他實質固態瘤。兩所中心於2019年獲基金額外資助1 億元，以研發包括治療不同癌症的新型藥物。